Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms