Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CACHD1Q5VU97 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms