Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKAP1Q5VSY0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKAP1Q5VSY0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms