Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARHGAP40Q5TG30 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP40Q5TG30 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms