Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH8Q5T0T0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms