Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms