Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL4Q5MAI5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms