Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITRM1Q5JRX3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms