Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf38Q5JPI3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms