Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RTL5Q5HYW3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTL5Q5HYW3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms