Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF628Q5EBL2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF628Q5EBL2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms