Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms