Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALFQ53S48 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms