Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6CQ53S08 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms