Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms