Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP221Q4G0U5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP221Q4G0U5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms