Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TWISTNBQ3B726 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms