Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP5B1Q2VPB7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP5B1Q2VPB7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms