Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT3

CLEC16A, Protein CLEC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC16AQ2KHT3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC16AQ2KHT3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLEC16AQ2KHT3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC16AQ2KHT3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms