Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX7Q2KHR2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms