Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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