Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNOP1Q1ED39 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNOP1Q1ED39 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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