Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKPD1Q17RQ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKPD1Q17RQ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms