Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FOXD1Q16676 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
FOXD1Q16676 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 298.7 ms