Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIL3Q16649 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIL3Q16649 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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