Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 CDKN1A-205ENST00000459970 604 ntTSL 514□□□□□ -0.176e-9■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.186e-9■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 CDKN1A-207ENST00000478800 616 ntTSL 213.41□□□□□ -0.266e-9■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.386e-9■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.576e-9■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -01e-6■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 521.13■□□□□ 0.971e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 218.5■□□□□ 0.551e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.321e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)15.96■□□□□ 0.151e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 214.9□□□□□ -0.021e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 214.44□□□□□ -0.11e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.221e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 TAF15-206ENST00000603967 656 ntTSL 313.08□□□□□ -0.321e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 TAF15-210ENST00000604694 891 ntTSL 513.08□□□□□ -0.321e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 412.37□□□□□ -0.431e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 511.69□□□□□ -0.541e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.691e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.721e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ILF3-204ENST00000585835 849 ntTSL 310.54□□□□□ -0.721e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.741e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 29.36□□□□□ -0.911e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.981e-8■■■□□ 16
SRSF7Q16629 PLCG1-206ENST00000470528 510 ntTSL 415.67■□□□□ 0.17e-7■■■□□ 16
SRSF7Q16629 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.037e-7■■■□□ 16
SRSF7Q16629 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.037e-7■■■□□ 16
SRSF7Q16629 PLCG1-212ENST00000492148 597 ntTSL 210.63□□□□□ -0.717e-7■■■□□ 16
SRSF7Q16629 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 214.61□□□□□ -0.074e-8■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-6■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.143e-6■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.43e-6■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.73e-6■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.091e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.431e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 AHCY-206ENST00000606061 1170 ntTSL 215.93■□□□□ 0.141e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-201ENST00000428029 1024 ntTSL 215.19■□□□□ 0.021e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-210ENST00000543167 1059 ntTSL 213.5□□□□□ -0.251e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 513.22□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 AHCY-204ENST00000480653 2211 ntTSL 213.21□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 513.12□□□□□ -0.311e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.361e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.421e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-208ENST00000541694 875 ntTSL 212.33□□□□□ -0.441e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.491e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 GCKR-204ENST00000453813 701 ntTSL 311.57□□□□□ -0.561e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 AHCY-202ENST00000468908 675 ntTSL 511.32□□□□□ -0.61e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.661e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 GCKR-205ENST00000472290 1302 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.711e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 GCKR-203ENST00000417872 568 ntTSL 410.54□□□□□ -0.721e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)10.12□□□□□ -0.791e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 AHCY-203ENST00000473516 488 ntTSL 39.78□□□□□ -0.841e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 LINC01089-212ENST00000545885 559 ntTSL 27.33□□□□□ -1.241e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.091e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.031e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 RBCK1-209ENST00000415942 2613 ntTSL 514.68□□□□□ -0.061e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.061e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 RBCK1-204ENST00000382214 2752 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.311e-7■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 PNISR-208ENST00000481229 395 ntTSL 36.01□□□□□ -1.451e-14■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.634e-10■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.864e-10■■■□□ 15.9
SRSF7Q16629 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.133e-7■■■□□ 15.7
SRSF7Q16629 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-7■■■□□ 15.7
SRSF7Q16629 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.493e-7■■■□□ 15.7
SRSF7Q16629 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-7■■■□□ 15.7
SRSF7Q16629 SPTA1-206ENST00000484520 769 ntTSL 34.24□□□□□ -1.732e-8■■■□□ 15.7
SRSF7Q16629 LAMB1-205ENST00000439976 703 ntTSL 512.49□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 15.7
SRSF7Q16629 LAMB1-202ENST00000393559 550 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-6■■■□□ 15.7
SRSF7Q16629 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-6■■■□□ 15.7
SRSF7Q16629 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-6■■■□□ 15.7
SRSF7Q16629 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.121e-27■■■□□ 15.6
SRSF7Q16629 LDB1-204ENST00000490751 762 ntTSL 224.4■■□□□ 1.52e-8■■■□□ 15.5
SRSF7Q16629 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.192e-8■■■□□ 15.5
SRSF7Q16629 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.672e-8■■■□□ 15.5
SRSF7Q16629 CDC42SE1-203ENST00000470278 939 ntTSL 512.16□□□□□ -0.466e-6■■■□□ 15.5
SRSF7Q16629 CDC42SE1-207ENST00000540998 3181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.026e-6■■■□□ 15.5
SRSF7Q16629 CDC42SE1-206ENST00000492796 1174 ntTSL 28.5□□□□□ -1.056e-6■■■□□ 15.5
SRSF7Q16629 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.116e-6■■■□□ 15.5
SRSF7Q16629 CDC42SE1-204ENST00000483763 2379 ntTSL 1 (best)7.45□□□□□ -1.226e-6■■■□□ 15.5
SRSF7Q16629 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.316e-6■■■□□ 15.5
SRSF7Q16629 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 513.66□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 15.4
SRSF7Q16629 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 15.4
SRSF7Q16629 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 311.87□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 15.4
SRSF7Q16629 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 57.49□□□□□ -1.211e-6■■■□□ 15.4
SRSF7Q16629 SET-208ENST00000477806 957 ntTSL 1 (best)8.82□□□□□ -14e-9■■■□□ 15.4
SRSF7Q16629 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-8■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 SEPT11-210ENST00000510641 1870 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.012e-8■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.112e-8■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.212e-8■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-8■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 LINC01029-203ENST00000582805 788 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.622e-8■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.852e-8■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 SEPT11-208ENST00000506731 659 ntTSL 55.53□□□□□ -1.522e-8■■■□□ 15.3
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