Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFE2Q16621 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFE2Q16621 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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