Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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KCNMB1Q16558 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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KCNMB1Q16558 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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KCNMB1Q16558 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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KCNMB1Q16558 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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KCNMB1Q16558 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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KCNMB1Q16558 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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KCNMB1Q16558 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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KCNMB1Q16558 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB1Q16558 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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