Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX1Q16384 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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