Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK4Q16099 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK4Q16099 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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