Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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ZFHX3Q15911 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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ZFHX3Q15911 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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ZFHX3Q15911 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ZFHX3Q15911 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ZFHX3Q15911 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZFHX3Q15911 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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ZFHX3Q15911 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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ZFHX3Q15911 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZFHX3Q15911 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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