Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA6Q15825 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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