Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB30Q15771 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB30Q15771 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB30Q15771 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
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