Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNHIT3Q15649 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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