Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRADDQ15628 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRADDQ15628 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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