Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3CQ15386 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3CQ15386 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3CQ15386 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3CQ15386 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3CQ15386 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3CQ15386 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3CQ15386 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3CQ15386 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBE3CQ15386 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE3CQ15386 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBE3CQ15386 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3CQ15386 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3CQ15386 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3CQ15386 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3CQ15386 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3CQ15386 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3CQ15386 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3CQ15386 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3CQ15386 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3CQ15386 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBE3CQ15386 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3CQ15386 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBE3CQ15386 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms