Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms