Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLD3Q15054 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLD3Q15054 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD3Q15054 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD3Q15054 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLD3Q15054 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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