Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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SETDB1Q15047 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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SETDB1Q15047 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETDB1Q15047 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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SETDB1Q15047 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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SETDB1Q15047 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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SETDB1Q15047 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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SETDB1Q15047 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETDB1Q15047 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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