Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KARSQ15046 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KARSQ15046 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KARSQ15046 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KARSQ15046 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KARSQ15046 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KARSQ15046 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KARSQ15046 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KARSQ15046 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KARSQ15046 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KARSQ15046 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KARSQ15046 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KARSQ15046 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KARSQ15046 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KARSQ15046 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KARSQ15046 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KARSQ15046 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KARSQ15046 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KARSQ15046 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KARSQ15046 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KARSQ15046 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KARSQ15046 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KARSQ15046 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KARSQ15046 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KARSQ15046 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KARSQ15046 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KARSQ15046 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KARSQ15046 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KARSQ15046 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KARSQ15046 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KARSQ15046 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KARSQ15046 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KARSQ15046 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KARSQ15046 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KARSQ15046 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KARSQ15046 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KARSQ15046 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KARSQ15046 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KARSQ15046 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KARSQ15046 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KARSQ15046 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KARSQ15046 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KARSQ15046 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KARSQ15046 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KARSQ15046 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KARSQ15046 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KARSQ15046 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KARSQ15046 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KARSQ15046 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KARSQ15046 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KARSQ15046 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KARSQ15046 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KARSQ15046 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KARSQ15046 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KARSQ15046 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KARSQ15046 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KARSQ15046 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KARSQ15046 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KARSQ15046 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KARSQ15046 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KARSQ15046 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KARSQ15046 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KARSQ15046 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KARSQ15046 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KARSQ15046 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KARSQ15046 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KARSQ15046 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KARSQ15046 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KARSQ15046 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KARSQ15046 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KARSQ15046 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KARSQ15046 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KARSQ15046 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KARSQ15046 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KARSQ15046 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KARSQ15046 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KARSQ15046 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KARSQ15046 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms