Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NCAPD2Q15021 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCAPD2Q15021 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
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