Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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