Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD6Q15008 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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