Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFIXQ14938 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFIXQ14938 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFIXQ14938 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFIXQ14938 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFIXQ14938 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFIXQ14938 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFIXQ14938 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFIXQ14938 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFIXQ14938 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIXQ14938 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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