Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPRIN1Q14444 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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