Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3CQ13748 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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