Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSTA3Q13630 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSTA3Q13630 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms