Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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