Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
EIF4EBP1Q13541 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EIF4EBP1Q13541 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms