Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBB3Q13509 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms