Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PICALMQ13492 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
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